醫院的污水性質特殊,來源及成分復雜,并且含有一些特殊的污染物,如藥物、消毒劑、診斷用劑、洗滌劑以及大量的病原性微生物。其水質與生活污水相似,但需強化后期深度處理及消毒單元,常規采用格柵攔截廢水中大塊雜物,然后生化去除廢水中的有機污染物,最終通過高效過濾器、活性炭過濾器等深度處理手段確保出水達標,最終出水需經消毒裝置消毒后方可排放或回用。